色譜其本質是一種分離分析方法，利用樣品中各組分與流動相和固定相的作用力不同(吸附、分配、交換等性能上的差異)，先將它們分離，后按一定順序檢測各組分及其含量的方法。
色譜前處理
提取：使待測組分的濃度不要過低或過高，造成儀器檢測困難 凈化：去除雜質干擾(固相萃取) 濃縮：酸堿度、離子強度等易造成系統污染 衍生化：生成新物質，增強儀器檢測信號
色譜儀工作原理
待測樣品溶液經進樣器進入流動相(氣體或液體)，被流動相載入色譜柱(固定相) 內，由于樣品溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數，在兩相中作相對運動時，經過反復多次的吸附- 解吸的分配過程， 被分離成單個組分依次從柱內流出，經過檢測器時，樣品濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀，數據以圖譜形式打印出來。
氣相色譜儀
氣相色譜儀的組成：氣路系統、進樣系統、分離系統、檢測系統、溫控系統、記錄系統
流動相：常用的氣相色譜流動相N2、He等
分離柱：毛細管色譜柱
檢測器：氫火焰離子化檢測器(FID)、電子俘獲檢測器(ECD)、火焰光度檢測器(FPD)等。
液相色譜儀
儀器組成：進樣系統、輸液系統、分離系統、檢測系統和數據處理系統
色譜柱：一般柱長為 10～50cm，內徑為 2～5mm，由不銹鋼或厚壁玻璃管或鈦合金等材料制成，柱內裝有直徑為 5～10μm 粒度的固定相(由基質和固定液構成)。
檢測器：紫外檢測器(適用于對紫外光或可見光有吸收性能樣品的檢測)。熒光檢測器(適用于具有熒光的有機化合物的測定)。
