脯氨酸（茚三酮法）
當用磺基水楊酸提取植物樣品時，脯氨酸便游離于磺基水楊酸溶液中，然后用酸性茚三酮加熱處理后，茚三酮與脯氨酸發生反應，溶液變為紅色，再用甲苯處理，則色素全部轉移至甲苯中，色素的深淺即表示脯氨酸含量的高低。在λ520 nm波長下測定吸光度，即可從標準曲線上查出脯氨酸的含量。
可溶性糖（蒽酮法）
糖（sugar）在濃硫酸作用下，可經脫水反應生成糠醛或羥甲基糠醛，生成的糠醛或羥甲基糠醛可與蒽酮反應生成藍綠色糠醛衍生物，在一定范圍內，顏色的深淺與糖的含量成正比，故可用于糖的定量測定。該法幾乎可以測定所有的碳水化合物，不但可以測定戊糖與己糖含量，而且可以測所有寡糖類和多糖類，其中包括淀粉、纖維素等（因為反應液中的濃硫酸可以把多糖水解成單糖而發生反應），所以用蒽酮法測出的碳水化合物含量，實際上是溶液中全部可溶性碳水化合物總量。糖類與蒽酮反應生成的有色物質在 λ 620 nm處有最大吸收峰，故在此波長下進行比色。
可溶性蛋白（考馬斯亮藍法）
考馬斯亮藍G-250法（Coomassie brilliant blue，G-250）是一種利用蛋白質-染料結合的原理，定量測定微量蛋白質濃度的快速、靈敏的方法。考馬斯亮藍G-250存在著兩種不同的顏色形式，紅色和青色。該染料在游離狀態下為紅色，在酸性溶液中可與蛋白質的疏水區結合，顏色由紅色轉變成青色，其最大光吸收由 λ 465 nm變成 λ 595 nm。在一定蛋白質濃度范圍內（1-1000μg），蛋白質-染料復合物在 λ 595 nm下的吸光度與蛋白質含量成正比。蛋白質和染料結合是一個很快的過程，約2 min即可反應完全，呈現最大光吸收，并可穩定1 h，之后蛋白質-染料復合物發生聚合并沉淀出來。
超氧物歧化酶SOD（NBT法）
超氧物歧化酶（superoxidedismutase，SOD）普遍存在于動、植物體內，是一種清除超氧陰離子自由基（O2·-）的酶。本項目依據SOD抑制氮藍四唑（NBT）在光下的還原作用來確定酶活性大小。在有氧化物質存在下，核黃素可被光還原，被還原的核黃素在有氧條件下極易再氧化而產生O2·-，可將氮藍四唑還原為藍色的甲腙，后者在560nm處有最大吸收。而 SOD可清除O2·-，從而抑制了甲腙的形成。于是光還原反應后，反應液藍色愈深，說明酶活性愈低，反之酶活性愈高。據此可以計算出酶活性大小。
過氧化物酶（愈創木酚法）
在過氧化物酶（peroxidase，POD）催化下，雙氧水（H2O2）將愈創木酚氧化成茶褐色產物，此產物在 λ 470 nm處有最大吸收峰，故可以通過測其吸光度的變化測定過氧化物酶的活性。
過氧化氫酶CAT（紫外法）
過氧化氫酶（catalase，CAT）是一種廣泛存在于生物組織中的氧化還原酶，它能催化過氧化氫（H2O2）分解為水和氧氣，清除組織中的過氧化氫。H2O2在 λ 240 nm處有一個吸收高峰，其吸光度與H2O2的含量成正比，過氧化氫酶能分解H2O2，使反應溶液吸光度A240隨反應時間而降低。單位時間內吸收的差值就是過氧化氫酶的活性。
